Jak najít správné odborníky, technologie nebo výzkumná pracoviště pro nový projekt zaměřený na rakovinu? Pomoci může umělá inteligence. Národní ústav pro výzkum rakoviny (NÚVR) se zapojil do letošního Rakathonu, největšího AI hackathonu proti rakovině na světě, s vlastní výzvou zaměřenou na propojování výzkumných týmů. Jejím vítězem se stal projekt OncoMatch, který dokáže na základě vědeckého záměru doporučit vhodné partnery pro spolupráci. NÚVR nyní plánuje s jeho autory pokračovat ve vývoji a ověřit možnosti využití nástroje ve výzkumné praxi.
Rakathon 2026 se uskutečnil od 16. do 18. října současně v Praze, Brně a Ostravě. Akce, která propojuje odborníky z medicíny, vědy a informačních technologií, přinesla řadu inovativních řešení konkrétních problémů české onkologie. Jedním ze zadavatelů výzev byl také Národní ústav pro výzkum rakoviny, který účastníky postavil před úkol vytvořit inteligentní nástroj usnadňující spolupráci mezi výzkumnými pracovišti.
Český onkologický výzkum disponuje špičkovými odborníky, moderními technologiemi i rozsáhlými výzkumnými infrastrukturami. Najít pro konkrétní vědecký záměr ty nejvhodnější partnery však nemusí být jednoduché. Potřebné znalosti, technologie nebo biologické vzorky mohou být dostupné na jiném pracovišti, aniž by o nich výzkumníci věděli. Právě tento problém měla výzva NÚVR s názvem Research Matchmaker pomoci řešit.
„Za dobu fungování Národního ústavu pro výzkum rakoviny se nám podařilo výrazně posílit spolupráci mezi výzkumnými pracovišti a vytvořit prostředí, v němž se propojují odborníci z různých institucí a oborů. Umělá inteligence nám nyní nabízí nové možnosti, jak tento potenciál dále rozvíjet, vyhledávat vhodné partnery pro konkrétní výzkumné projekty – a to i na nadnárodní úrovni – a otevírat další příležitosti ke spolupráci. Rakathon ukázal, že i během jediného víkendu může vzniknout řešení, které má potenciál najít praktické uplatnění ve vědě,“ říká Aleksi Šedo, ředitel NÚVR, který se do Rakathonu zapojil také jako mentor a porotce.
Od vědecké otázky ke konkrétnímu týmu
Vítězem výzvy NÚVR se stal čtyřčlenný tým studentů, který si říká dudes, ve složení Zakhar Li (VŠE v Praze), Nikita Garbovskii (VŠFS), Daniil Khmelnytskyi a Daniil Sandakov (oba ČVUT v Praze). „Tuto výzvu jsme si vybrali proto, že jako jedna z mála letos nabízela příležitost přímo pomoci vědcům,“ vysvětluje oceněný tým a dodává: „Ze své zkušenosti víme, jak je někdy těžké najít k sobě do týmu někoho, koho právě nutně potřebujeme. Naše řešení je zatím ve stadiu pilotu, jsou v něm data o výzkumných skupinách NÚVR, ale je škálovatelné a dá se poměrně snadno rozšířit na vědeckou komunitu po celém světě.“
Projekt OncoMatch funguje na jednoduchém principu: výzkumník zadá svou vědeckou hypotézu nebo záměr a systém mu doporučí odborníky, kteří mají potřebné zkušenosti, znalosti či přístup k odpovídajícím technologiím. Na rozdíl od běžného internetového vyhledávání přitom OncoMatch nehledá pouze shodu klíčových slov. Analyzuje vědecké publikace a informace o skutečném zapojení jednotlivých výzkumníků do studií. Dokáže tak například rozlišit, kdo se podílel na návrhu výzkumu, kdo prováděl laboratorní analýzy nebo kdo zajišťoval biologické vzorky. U každého doporučení zároveň uvádí konkrétní vědecké publikace, o které svůj výběr opírá.
Představme si například vědce, který chce zkoumat nové možnosti léčby nádoru mozku. Pro svůj projekt potřebuje odborníka na nádorovou biologii, pracoviště disponující specifickou laboratorní technologií a klinického partnera, který se zabývá daným onemocněním. Namísto zdlouhavého hledání jednotlivých institucí mu OncoMatch může nabídnout návrh týmu, vysvětlit přínos i potenciál jednotlivých partnerů a upozornit i na případné chybějící odbornosti či metodické přístupy.
Při vývoji autoři využili veřejně dostupných informací o téměř dvou tisících výzkumnicích a výzkumnících a více než 4 600 vědeckých publikacích. Do systému zahrnuli také údaje o klinických studiích, výzkumných infrastrukturách a biobankách. Nástroj nepracuje s osobními zdravotními údaji pacientů.
„Chtěli jsme vytvořit nástroj, který vědcům nejen doporučí technologické potřeby a vhodné spolupracovníky, ale také dokáže vysvětlit, proč právě oni mohou být pro daný projekt přínosem. Důležité pro nás bylo, aby každé doporučení vycházelo z ověřitelných informací, nikoli pouze z odpovědi generované umělou inteligencí. Věříme, že OncoMatch může výzkumníkům ušetřit čas a pomoci jim navazovat spolupráce, ke kterým by se jinak obtížně dostávali,“ říkají autoři řešení OncoMatch.
Rakathonem spolupráce nekončí
Pro NÚVR představuje vítězný projekt příležitost posunout původní soutěžní zadání směrem k prakticky využitelnému nástroji. Společně s autory OncoMatch proto plánuje pokračovat v jeho vývoji a pilotním ověřování. Cílem bude zejména prověřit kvalitu doporučení, možnosti dalšího rozšíření datových zdrojů a využitelnost nástroje při přípravě společných výzkumných projektů.
Vítězný tým zároveň získal Cenu NÚVR v podobě účasti na mezinárodním multidisciplinárním kongresu Czech Annual Cancer Research Meeting, který se uskuteční od 23. do 25. listopadu 2026 v Olomouci. Kongres, na němž se setkávají přední odborníci na výzkum rakoviny z Česka i zahraničí, nabídne autorům projektu příležitost podílet se na efektivním budování vědeckých konsorcií podle faktických potřeb i případných podmínek poskytovatele.
„OncoMatch nás zaujal tím, že reaguje na skutečnou potřebu výzkumníků a nabízí konkrétní způsob, jak ji řešit. Přestože autoři nemají předchozí zkušenost v oblasti onkologie či nádorové biologie, dokázali přesně vycítit naše potřeby, uchopit je a navrhnout schéma, které, domnívám se, má velký potenciál mít mezinárodní přesah,“ říká Aleksi Šedo a uzavírá: „Velké poděkování patří organizátorům Rakathonu, kteří nás k této skvělé akci přizvali. Ukázali, jak velký potenciál má propojení vědy, medicíny a moderních technologií a že i během jediného víkendu mohou vzniknout nápady, které stojí za to dále rozvíjet.
